«`html
VirtuDockDL: Платформа для ускоренного открытия лекарств с помощью глубокого обучения
Открытие лекарств — это дорогостоящий и длительный процесс с высокой долей неудач. Обычно только одно жизнеспособное лекарство появляется из миллиона протестированных соединений. Современные технологии высокопроизводительного скрининга (HTS) и ультравысокопроизводительного скрининга (uHTS) позволяют быстро тестировать большие библиотеки соединений. Это дает возможность фармацевтическим и биотехнологическим компаниям исследовать больше химических соединений и новых биологических мишеней.
Проблемы и решения
Несмотря на новые технологии, все еще существуют вызовы, такие как ограниченное количество прорывов в выявлении новых мишеней для лекарств и проблемы с качеством данных. Здесь на помощь приходят машинное обучение (ML) и глубокое обучение (DL), которые предлагают эффективные решения для повышения эффективности открытия лекарств через аналитические данные, извлечение характеристик и предсказательные возможности.
Платформа VirtuDockDL
VirtuDockDL — это платформа на основе Python, разработанная исследователями, которая использует глубокое обучение для упрощения открытия лекарств. Она применяет графовую нейронную сеть (GNN) для предсказания эффективности соединений, достигнув точности 99% на наборе данных HER2, что превосходит другие инструменты.
Как это работает
Данные о молекулах сначала кодируются в строки SMILES, затем преобразуются в графовые представления. GNN обучается на этих данных для предсказания свойств, таких как молекулярная активность и аффинность связывания. Платформа включает автоматизированные инструменты для виртуального скрининга и кластеризации, что позволяет быстро оценивать большие библиотеки соединений.
Преимущества использования VirtuDockDL
- Высокая точность предсказаний.
- Автоматизированный процесс, позволяющий эффективно находить потенциальные лекарства.
- Легкий в использовании интерфейс для загрузки молекул и получения результатов.
Примеры применения
Платформа была применена к исследованию вируса Марбург, где GNN модель точно классифицировала соединения. Результаты виртуального скрининга и докинга автоматически визуализируются, предоставляя полезные данные для открытия новых ингибиторов.
Заключение
VirtuDockDL — это мощный инструмент для фармацевтических исследований, который сочетает в себе полную автоматизацию и удобный интерфейс. Он предлагает эффективные решения для открытия лекарств, включая ингибиторы для различных заболеваний.
Если вы хотите, чтобы ваша компания развивалась с помощью ИИ:
- Проанализируйте, как ИИ может изменить вашу работу.
- Определите, где возможно применение автоматизации.
- Установите ключевые показатели эффективности (KPI) для улучшения.
- Подберите подходящее решение и внедряйте ИИ постепенно.
Для получения советов по внедрению ИИ, пишите нам в Телеграм-канал.
Попробуйте AI Sales Bot. Это ИИ-ассистент для продаж, который помогает отвечать на вопросы клиентов и генерировать контент для отдела продаж.
«`
